HPV genotype là gì? Kỹ thuật phát hiện HPV DNA với kiểu gen

HPV genotype là gì?

HPV genotype là hình thức xét nghiệm Human Papillomavirus (HPV) phát hiện DNA với kiểu gen, các loại nguy cơ cao bằng PCR

Hữu ích cho

Phát hiện các kiểu gen có nguy cơ cao (HR) liên quan đến sự phát triển của ung thư cổ tử cung

Hỗ trợ trong việc phân loại phụ nữ với kết quả Pap smear bất thường

HPV genotype cá nhân của papillomavirus ở người (HPV): HPV genotype 6/11HPV 16 và/hoặc HPV 18

Kết quả của kiểu gen HPV-16 và HPV-18 có thể hỗ trợ trong việc phân loại phụ nữ với HR-HPV dương tính nhưng xét nghiệm Pap smear âm tính

Các phương thức HPV genotype

HPV Genotyping phản ứng chuỗi polymerase thời gian thực (PCR)

Tên báo cáo

HPV với kiểu gen, PCR
HPV nguy cơ cao
HPV (Human Papillomavirus) PCR
Human Papillomavirus (HPV) Kiểu gen

Loại mẫu HPV genotype
Khác nhau
Thông tin cần thiết
Nguồn mẫu là bắt buộc.

HPV genotype là gì

HPV genotype là gì

Yêu cầu mẫu HPV genotype

Chỉ gửi 1 trong các mẫu sau:

Loại mẫu: Cổ tử cung hoặc ectocervical)

Vùng chứa / ống: lọ giải pháp ThinPrep / PreservCyt

Thể tích mẫu: 3 mL dung dịch trong lọ ThinPrep / PreservCyt

Hướng dẫn thu thập HPV genotype

1. Lấy mẫu ThinPrep riêng lẻ vì chúng có xu hướng rò rỉ trong quá trình vận chuyển.

2. Đặt nhãn lên lọ và trên túi.

Loại mẫu vật: Âm đạo

Vùng chứa / ống: lọ giải pháp ThinPrep / PreservCyt

Thể tích mẫu: 3 mL dung dịch trong lọ ThinPrep / PreservCyt

Hướng dẫn thu thập:

1. Lấy mẫu ThinPrep riêng lẻ vì chúng có xu hướng rò rỉ trong quá trình vận chuyển.

2. Đặt nhãn lên lọ và trên túi.

Thông tin lâm sàng

Nhiễm trùng dai dẳng với papillomavirus ở người (HPV) là nguyên nhân chính gây ung thư và tiền thân trong tử cung cổ tử cung (CIN). (1-3) Sự hiện diện của HPV đã được liên quan đến hơn 99% ung thư trên toàn thế giới. HPV là một virut DNA sợi đôi, không có vỏ bọc nhỏ, có bộ gen khoảng 8.000 nucleotide. Có hơn 118 loại HPV khác nhau và khoảng 40 loại HPV khác nhau có thể lây nhiễm vào niêm mạc sinh dục của con người. Tuy nhiên, dữ liệu HPV Genotyping cho thấy 14 trong số các loại này (các loại HPV 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 và 68) được xem là có nguy cơ cao (HR) đối với phát triển ung thư và tổn thương tiền thân của nó. Hơn nữa, HPV loại 16 và 18 đã được coi là kiểu gen liên quan chặt chẽ nhất với sự tiến triển của ung thư.

Mặc dù nhiễm trùng dai dẳng với HPV nhân sự là cần thiết cho sự phát triển của ung thư và tổn thương tiền thân của nó, chỉ có một tỷ lệ rất nhỏ các nhiễm trùng tiến triển đến các trạng thái bệnh này. Nhiễm trùng lây truyền qua đường tình dục với HPV là rất phổ biến, với ước tính lên đến 75% của tất cả phụ nữ bị phơi nhiễm với HPV tại một số điểm. Tuy nhiên, hầu như tất cả phụ nữ bị nhiễm sẽ gắn kết một phản ứng miễn dịch có hiệu quả và rõ ràng nhiễm trùng trong vòng 2 năm mà không có bất kỳ hậu quả sức khỏe lâu dài nào. Nhiễm trùng với bất kỳ loại HPV nào cũng có thể sinh ra CIN, mặc dù điều này cũng thường giải quyết sau khi nhiễm HPV đã bị xóa.

Ở các nước phát triển với các chương trình sàng lọc ung thư, Pap smear đã được sử dụng từ giữa những năm 1950 như là công cụ chính để phát hiện tiền chất sớm của ung thư. Mặc dù nó đã làm giảm tỷ lệ tử vong do ung thư ở những nước này, nhưng phương pháp xét nghiệm tế bào gốc và chất lỏng tiếp theo đòi hỏi sự giải thích chủ quan bởi các nhà tế bào học được đào tạo cao và có thể diễn giải sai. Bất thường về mặt tế bào chủ yếu là do nhiễm HPV; tuy nhiên, các điều kiện viêm khác nhau hoặc các biến thể lấy mẫu có thể dẫn đến xét nghiệm tế bào dương tính giả. Triage của một kết quả tế bào học bất thường có thể liên quan đến thử nghiệm lặp lại, và sinh thiết. Một tổn thương cấp tính xác nhận mô học phải được phẫu thuật cắt bỏ hoặc cắt bỏ để ngăn chặn sự phát triển của ung thư xâm lấn.

Xét nghiệm axit nucleic (DNA) bằng PCR đã trở thành một phương pháp tiêu chuẩn, không xâm lấn để xác định sự hiện diện của nhiễm HPV. Thực hiện đúng thử nghiệm acid nucleic cho HPV có thể 1) tăng độ nhạy của các chương trình sàng lọc ung thư bằng cách phát hiện tổn thương nguy cơ cao sớm hơn ở phụ nữ từ 30 tuổi trở lên với tế bào học bình thường và 2) giảm nhu cầu soi và điều trị không cần thiết ở bệnh nhân 21 cũ hơn với kết quả tế bào học cho thấy các tế bào vảy không điển hình có ý nghĩa không xác định (ASC-US).

Gần đây, dữ liệu cho thấy rằng kiểu gen cá nhân cho các loại HPV 16 và 18 có thể hỗ trợ trong việc xác định thử nghiệm theo dõi thích hợp và phụ nữ phân loại có nguy cơ tiến triển ung thư cổ tử cung. Các nghiên cứu đã chỉ ra rằng nguy cơ tuyệt đối của CIN-2 hoặc nặng hơn ở HPV-16 và / hoặc HPV-18 dương tính là 11,4% (khoảng tin cậy 95% [CI] 8,4% -14,8%) so với 6,1% (KTC 95%) , 4,9% -7,2%) phụ nữ dương tính với các kiểu gen HR-HPV khác, và 0,8% (95% CI, 0,3% -1,5%) ở phụ nữ âm tính-HPV âm tính (4) Dựa trên một phần dữ liệu này, American Society cho Colposcopy và bệnh lý (ASCCP) bây giờ đề nghị rằng HPV 16/18 kiểu gen được thực hiện trên những phụ nữ tích cực cho HR-HPV nhưng tiêu cực bởi cytology thường quy. Phụ nữ được cho là dương tính với HPV-16 và / hoặc -18 có thể được đề cập đến soi cổ tử cung,

Giá trị HPV genotype tham khảo

Tiêu cực đối với kiểu gen papillomavirus (HPV) ở người 6, 11, 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 và 68

Diễn dịch

HPV genotype dương tính là gì: Một kết quả dương tính cho thấy sự hiện diện của virus papillomavirus (HPV) ở người do một hoặc nhiều kiểu gen sau đây: 6, 11, 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 và 68.

Một chẩn đoán âm tính cho thấy sự vắng mặt của DNA HPV của các kiểu gen được nhắm mục tiêu.

Đối với bệnh nhân có các tế bào vảy không điển hình có ý nghĩa không xác định (ASC-US) xét nghiệm Pap smear và dương tính với HPV có nguy cơ cao (HR), xem xét giới thiệu cho soi cổ tử cung, nếu được chỉ định lâm sàng.

HPV genotype là gì

Giá trị xét nghiệm HPV genotype tham khảo

Đối với phụ nữ từ 30 tuổi trở lên có xét nghiệm Pap smear âm tính nhưng dương tính với HPV-16 và / hoặc HPV-18, hãy xem xét giới thiệu cho soi cổ tử cung, nếu được chỉ định lâm sàng.

Đối với phụ nữ từ 30 tuổi trở lên có xét nghiệm dương tính với xét nghiệm dương tính với HRV, nhưng âm tính với HPV-16 và HPV-18, xem xét xét nghiệm lặp lại bằng cả xét nghiệm tế bào và xét nghiệm HR-HPV trong 12 tháng.

Thận trọng khi làm HPV genotype

Những lưu ý khi làm HPV genotype là gì: Xét nghiệm papillomavirus (HPV) cobas human được FDA chấp thuận cho các mẫu và nội soi được thu thập trong phương tiện PreservCyt (ThinPrep). Các loại mẫu khác (ví dụ, âm đạo) không được coi là nguồn được FDA chấp thuận; tuy nhiên, các nghiên cứu xác minh đã được hoàn thành bởi các phòng thí nghiệm y tế Mayo và Mayo Clinic tuân thủ các quy định CLIA.

Thử nghiệm HPV cobas phát hiện DNA của các loại nguy cơ cao 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 và 68. Xét nghiệm này không phát hiện được DNA của HPV thấp các loại -risk (ví dụ, 6, 11, 42, 43, 44) vì chúng không liên quan đến ung thư và tổn thương tiền thân của nó.

Thử nghiệm HPV cobas không được khuyến cáo để đánh giá tình trạng lạm dụng tình dục bị nghi ngờ.

Tỷ lệ nhiễm HPV trong dân số có thể ảnh hưởng đến hiệu suất. Giá trị dự đoán tích cực giảm khi thử nghiệm các quần thể có tỷ lệ hiện nhiễm thấp hoặc những người không có nguy cơ nhiễm trùng.

Nhiễm HPV không phải là dấu hiệu của tổn thương nội sọ cao cấp (HSIL) hoặc ung thư biểu mô tiềm ẩn (CIN), cũng không có nghĩa là CIN2-3 hoặc ung thư sẽ phát triển. Hầu hết phụ nữ bị nhiễm 1 hoặc nhiều loại HPV nguy cơ cao (HR) không phát triển CIN2-3 hoặc ung thư.

Âm tính-HR-HPV không loại trừ khả năng HSIL cytologic trong tương lai hoặc CIN2-3 cơ bản hoặc ung thư.

Các mẫu vật thường cho thấy mức độ phát hiện rõ ràng của toàn bộ máu là màu hồng hoặc nâu nhạt. Những mẫu này được xử lý bình thường trên hệ thống cobas 4800. Nếu nồng độ của toàn bộ máu vượt quá 1,5% (màu đỏ sậm hoặc nâu) trong dung dịch PreservCyt, có khả năng thu được âm tính giả.

Hiệu suất Thử nghiệm HPV Genotyping cobas chưa được xác nhận với các mẫu PreservCyt đã được xử lý bằng axit axetic băng để loại bỏ các tế bào máu đỏ. Bất kỳ việc xử lý mẫu PreservCyt nào trước khi xét nghiệm HPV sẽ làm mất hiệu lực xét nghiệm HPV cobas.

Hiệu suất Thử nghiệm HPV cobas chưa được xác nhận bằng các mẫu PreservCyt đã được lấp đầy qua vạch đầy tối đa của lọ chính. Các lọ thuốc ThinPrep có bất kỳ thể tích chất lỏng bổ sung PreservCyt nào được thêm vào hoặc bất kỳ thể tích chất lỏng không tương tự nào được thêm vào mẫu ban đầu sẽ không được nộp để xét nghiệm.

Sự hiện diện của các chất ức chế PCR có thể gây ra âm tính hoặc không hợp lệ sai.

Thử nghiệm HPV cobas không nhằm mục đích sử dụng trong việc xác định nhu cầu điều trị (ví dụ, điều trị cắt bỏ hoặc cắt bỏ) trong trường hợp không có biến sản cấp cao. Bệnh nhân được HPV16 / 18 dương tính nên được theo dõi cẩn thận cho sự phát triển của loạn sản cao cấp theo hướng dẫn thực hành hiện hành.

Thử nghiệm HPV cobas không dành cho phụ nữ đã trải qua cắt bỏ tử cung.

Thử nghiệm HPV cobas không nhằm mục đích sử dụng với các mẫu khác với các mẫu được thu thập bởi một bác sĩ lâm sàng bằng cách sử dụng một bàn chải hoặc thìa và được đặt trong dung dịch thử nghiệm PreservCyt của ThinPrep Pap.

Các bệnh ung thư âm tính do HPV âm tính của cổ tử cung xảy ra trong những trường hợp hiếm hoi. Ngoài ra, không có xét nghiệm sàng lọc ung thư nào nhạy cảm 100%. Sử dụng thiết bị này để sàng lọc ung thư sơ cấp nên được thực hiện sau khi xem xét cẩn thận các đặc tính hiệu suất được nêu trong nhãn Thử nghiệm HPV cobas, cũng như các khuyến nghị về hướng dẫn chuyên môn.

Việc sử dụng xét nghiệm này chưa được đánh giá để quản lý phụ nữ với liệu pháp ablative hoặc excisional trước, cắt bỏ tử cung, những người đang mang thai hoặc có các yếu tố nguy cơ khác (ví dụ, HIV +, suy giảm miễn dịch, tiền sử nhiễm trùng lây truyền qua đường tình dục).

HPV genotype là gì

Ảnh hưởng của các biến tiềm năng khác như tiết dịch âm đạo, sử dụng băng vệ sinh, douching, vv, và các biến thu thập mẫu vật chưa được đánh giá.

Sự hiện diện của các chất ức chế PCR có thể gây ra âm tính giả hoặc không hợp lệ.

Dữ liệu hỗ trợ HPV genotype

Độ chính xác:

Để đánh giá độ chính xác của xét nghiệm vi rút papillomavirus (HPV) của Roche, các mẫu cổ tử cung thu được (n = 753) trong môi trường ThinPrep được kiểm tra bằng cả xét nghiệm Digene hc2 (Qiagen) và Roche cobas HPV.

Bảng 1. So sánh xét nghiệm Roche cobas 4800 HPV và Digene hc2 bằng cách sử dụng các mẫu cổ tử cung thu thập được trong môi trường ThinPrep (n = 753)

Digene hc2
Tích cựcTiêu cựcToàn bộ
Roche

Cobas 4800

Tích cực35326 (a)379
Tiêu cực42 (b)332374
Toàn bộ395358753

Thỏa thuận chung: 91,0% (88,7-92,8%)

a. Khi được thử nghiệm bằng xét nghiệm HPV genotype có nguy cơ cao (HR) -HPV được FDA chấp thuận thứ ba, 4 trong số các mẫu này có kết quả dương tính và 22 âm tính.

b. Khi được thử nghiệm bằng xét nghiệm HR-HPV thứ ba được FDA chấp thuận, 13 trong số các mẫu này có kết quả dương tính và 29 âm tính.

Ngoài việc so sánh các dữ liệu chính xác trên, Roche Cobas HPV khảo nghiệm cũng được so sánh với kết quả soi (sinh thiết mô) (n = 350), với một thiết bị đầu cuối lâm sàng của tân sinh trong biểu mô (CIN) 2 hoặc tệ hơn được coi là tích cực. Các kết quả được tóm tắt dưới đây trong Bảng 2.

Bảng 2. So sánh xét nghiệm vi khuẩn Roche cobas 4800 HPV với sinh thiết trong số 350 mẫu cho thấy các tế bào vảy không điển hình có ý nghĩa không xác định (ASC-US) hoặc nặng hơn bởi tế bào học (Pap smear).

Chẩn đoán mô> hoặc = CIN2
Tích cựcTiêu cựcToàn bộ
Roche

Cobas 4800

Tích cực74185259
Tiêu cực78491
Toàn bộ81269350

Độ nhạy = 91,4%

Cụ thể = 31,2%

Trong khi đó, xét nghiệm Digene hc2 hiện tại cho thấy độ nhạy 97,5% (79/81) và độ đặc hiệu 27,1% (73/269) so với điểm cuối soi cổ tử cung> hoặc = CIN2.

Cuối cùng, kết quả của xét nghiệm HPV genotype của Roche cobas HPV-16/18 được so sánh với chẩn đoán mô> hoặc = CIN2.

Bảng 3. So sánh xét nghiệm kiểu gen Roche cobas 4800 HPV 16/18 với sinh thiết trong 350 mẫu được xác định là ASC-US bởi tế bào học (Pap smear).

Chẩn đoán mô> hoặc = CIN2 *
Tích cựcTiêu cựcToàn bộ
Roche

Cobas 4800

16/18

Tích cực42 (a)36 (c)78
Tiêu cực39 (b)233272
Toàn bộ81269350

Độ nhạy = 51,9%

Độ đặc hiệu = 86,6%

HPV genotype là gì

a. 41 trong số những mẫu vật này cũng dương tính với GenProbe APTIMA đối với HPV mRNA (không phải kiểu gen)

b. 32 mẫu vật được Roche dương tính với các loại HPV khác hơn 16/18. 33 cũng dương tính với GenProbe APTIMA đối với HPV, không được quy định khác (NOS).

c. 31 dương tính với GenProbe APTIMA cho HPV, NOS.

Phạm vi tham chiếu HPV genotype

Từ 30 tuổi trở lên và các tế bào biểu mô (Pap) và HPV cotesting, các mẫu CTC / niệu đạo (n = 30) và âm đạo (n = 28) thu thập trong môi trường ThinPrep để sàng lọc HPV định kỳ đã được thử nghiệm.

58 trong số 58 (100%) mẫu CTC / âm đạo và âm đạo được thử nghiệm có kết quả Pap âm tính, âm tính Roche cobas HPV 4800, và kết quả Digene hc2 âm tính.

Phạm vi tham chiếu cho xét nghiệm HPV genotype của Roche cobas là âm tính.